การสร้างแบบจำลองสัตว์ที่เลียนแบบโรคของมนุษย์ และการสร้างฝูงสัตว์เกษตรชั้นยอด ขั้นตอนการโคลนนิ่งเกี่ยวข้องกับการเอานิวเคลียสหรือศูนย์บัญชาการทางพันธุกรรมของไข่ออก แล้วแทนที่ด้วยนิวเคลียสของเซลล์ผู้ใหญ่ ไข่จะรีเซ็ตนาฬิกาพัฒนาการของเซลล์ผู้ใหญ่ให้กลับสู่สถานะตัวอ่อนและก่อให้เกิดสิ่งมีชีวิตใหม่ที่มีลักษณะทางพันธุกรรมเหมือนกับผู้ใหญ่ที่บริจาค อย่างไรก็ตาม ในทางปฏิบัติ ขั้นตอนง่ายๆ ตามทฤษฎีได้พิสูจน์แล้วว่ายุ่งยากสัตว์โคลนนิ่งและรกที่หล่อเลี้ยงพวกมันก่อนเกิดมักจะมีขนาดใหญ่กว่าสัตว์ปกติอย่างมาก สัตว์มักจะได้รับความพิการแต่กำเนิดและตายภายในไม่กี่ชั่วโมงหลังคลอด ปัญหาเหล่านี้เรียกรวมกันว่ากลุ่มอาการลูกหลานขนาดใหญ่ ส่งผลให้สัตว์ โคลนนิ่ง เพียง 1-5 เปอร์เซ็นต์เท่านั้นที่รอดชีวิตจนถึงวัยโตเต็มวัย สาเหตุของภาวะแทรกซ้อนเหล่านี้ยังคงเป็นปริศนาและสร้างความกังวลอย่างมากเกี่ยวกับกระบวนการโคลนนิ่งห้องทดลองของ Jaenisch พบว่าภูมิหลังทางพันธุกรรมของนิวเคลียสที่ได้รับบริจาคมีอิทธิพลต่อการอยู่รอดของโคลนนิ่ง โดยไม่ขึ้นกับขั้นตอนการโคลนนิ่ง